L’any 1634 Les Escaules rep el privilegi de tenir municipi propi i se separa de Llers (concessió signada per Magdalena Rocabertí). L’any 1691, després d’una greu epidèmia de l’any 1640 que deixà les Escaules amb 5 cases habitades, el bisbe uní la parròquia de Sant Martí a la de Santa Cecília de Boadella (que havia aconseguit separar-se de la matriu de Terrades l’any 1610).
El s.XVIII fou una etapa de creixement econòmic i demogràfic, tant per Boadella com per les Escaules. L’expansió dels conreus de la vinya i olivera i l’augment d’habitants feren créixer els dos pobles i li donaren l’estructura que més o menys presenten en l’actualitat. La majoria de cases són del segle XVIII.
L’any 1718 Boadella tenia 93 habitants i les Escaules 67. L’any 1787 Les Escaules tenia 214 habitants i Boadella 247. Aquest augment d´habitants propicià la separació de la parròquia de Les Escaules de la de Boadella (any 1765). La prosperitat econòmica es veié estroncada per les guerres contra França, en què durant uns anys aquests pobles esdevingueren camp de batalla entre els exèrcits espanyol i francès i foren abandonats pels seus veïns.